MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cronobacter sakazakii Sp291 plasmid pSP291-3

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020262	GAT	2	6	238	243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306423
2	NC_020262	CGG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306423
3	NC_020262	GCCGG	2	10	278	287	0 %	0 %	60 %	40 %	449306423
4	NC_020262	TCT	2	6	295	300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306423
5	NC_020262	GAA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306423
6	NC_020262	GAA	2	6	388	393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449306423
7	NC_020262	GCT	2	6	577	582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306423
8	NC_020262	GGC	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306423
9	NC_020262	TAC	2	6	605	610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306423
10	NC_020262	CCG	2	6	697	702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306423
11	NC_020262	AGG	2	6	741	746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449306423
12	NC_020262	CG	3	6	762	767	0 %	0 %	50 %	50 %	449306423
13	NC_020262	CTG	2	6	770	775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306423
14	NC_020262	GGT	2	6	847	852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306423
15	NC_020262	CAC	2	6	856	861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449306423
16	NC_020262	AGC	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
17	NC_020262	CGAGCA	2	12	1018	1029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
18	NC_020262	GAG	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449306424
19	NC_020262	CGG	2	6	1124	1129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449306424
20	NC_020262	GCT	2	6	1183	1188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449306424
21	NC_020262	TGG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306424
22	NC_020262	GCA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
23	NC_020262	CAG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
24	NC_020262	AGC	2	6	1319	1324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
25	NC_020262	GCC	2	6	1348	1353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449306424
26	NC_020262	ACG	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
27	NC_020262	GAC	2	6	1387	1392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306424
28	NC_020262	AGC	2	6	1461	1466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306425
29	NC_020262	CAG	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306425
30	NC_020262	ACT	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449306425
31	NC_020262	TG	3	6	1530	1535	0 %	50 %	50 %	0 %	449306425
32	NC_020262	AGC	2	6	1611	1616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306425
33	NC_020262	T	6	6	2367	2372	0 %	100 %	0 %	0 %	449306426
34	NC_020262	A	6	6	2393	2398	100 %	0 %	0 %	0 %	449306426
35	NC_020262	TTC	2	6	2425	2430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449306426
36	NC_020262	TGCTTT	2	12	2433	2444	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	449306426
37	NC_020262	TAT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449306427
38	NC_020262	TCC	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449306427
39	NC_020262	A	6	6	3182	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	449306427
40	NC_020262	GAT	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306427
41	NC_020262	ATG	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449306427
42	NC_020262	CGA	2	6	3264	3269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449306427
43	NC_020262	TGG	3	9	3279	3287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449306427

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.